（一）禅定治病的十个条件
《摩诃止观》卷八说，以禅定治病，根据人有病轻、病重等差别，见效有顿、渐、迟、速之异。但只要方法得当，并具备10个条件，没有不见效者。
10个条件为：
1、信：确信按正确方法修禅，必能治我此病，这是能见效的先决条件。
2、用：实修禅定。
3、勤：须于每日早晚专精修禅，每次以身上出微汗为度。
4、恒：持之以恒，不要间断。
5、别病：先须正确判断病因，识别病症。
6、方便：根据病情灵活运用治疗方法，可请现代医生用药物或请佛医给予治疗，不应死执一法。
7、久行不懈：坚持治疗，直到病除。
8、取舍：善于辨别损益，有效则行之，无效是止而不修。
9、善养护：除修禅外，还应善于保养，慎饮食，避寒热，不犯禁忌。
10、知遮障：不随便把坐禅中的境界和疗效向人宣说。
这10条，除知遮障外，其余皆与中医学气功所说的一致。
（二）修禅治病的六种方法
第一是修止法。修止法就是意守“忧陀那”（丹田），《摩诃止观》卷八说：“丹田是气海，能锁吞万病，若止心丹田，则气息调和，故能愈疾。”此法能治百病，又能发诸禅，是一种很好的修止门径。意守丹田，能治胸胁痛、背膂急、肩井痛、心热懊痛、烦不能食、心痉痛、脐下冷、上热下冷、阴阳不和、咳嗽等病。
第二是意守双足。《摩呵止观》卷八说：“常止心于足者，能治一切病。”这是因为人脑和五脏都在下半身，一般人平常气血多随思虑而上行，易使下身气血虚亏错乱，生种种病，若意守足，气血随意念下行，可令五脏安和，阴阳平衡，尤以治恍惚懊闷一类病疗效最佳。
意守足三里穴，能止痛，若守之犹不能止，可转而意守二足大拇指横纹。头痛、眼赤疼、唇口热、腹卒疼、耳聋、颈项强直等病，可于二足之间假想一境，专意守之。若因此而致腰足急痛，可意想二足下有一丈深的坑，意守坑底，便能止痛。
第三为意守病处。《摩呵止观》卷八说：“随诸病处，谛心止之，不出三日，无有异缘，无不得瘥。”止心病处，应按中医五行、五脏要生克之理，灵活掌握，不可死守一处。如肺强肝弱，为金克木，应意守肺，摄其中白气，肝病即愈。
第四是止心于头顶。这种方法专治身体沉重、枯瘠、痹痿、皮肤痒等一类病。
第五是急急摄心修止。此法可治虚肿胀膀、饮食不消、腹痛下痢一类病症。
第六是宽缓放心修止。此法能治举身洪热、骨节酸疼、呼吸顿乏、大小便不通。
大乘佛教本以“医方明”即医药学为修学菩萨道必须通达的“五明”（五种学问）之一，以医药布施度人济世为重要的修行。但自中唐以后，佛教以禅、净二宗为主，亟亟追求于当世解决生死问题，除少数寺院有行医传统外，对佛教医学包括禅定治病之说无多发展。
藏传佛教虽继承发展了印度晚期佛教的医方明，在禅定治病方法上有所发展，但在内地影响甚微。禅定治病法和现代医疗气功都已普遍采用，证明行之有效。另有许多佛教养生治病的方法，在《慧缘佛医学》一书中有详细的叙述。